1990-1999

為國內首位全方位人腦科學醫學與功能性腦造影的研究單位。  

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由戴院長東原、程院長東照簽下合作交流合約，期望為國內醫療、教學、學術研究樹立新的合作模式。

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與國立陽明大學合作建置。

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神經醫學中心鄭宏志醫師首創以截斷脊髓後下身完全癱瘓的大白鼠，採自體肋間神經移植，配合獨創的組織膠摻含生長素固定及白質再導引至灰質的方法，使後肢運動功能部分恢復。成果發表知名期刊“Science”，受到全球醫學界重視，美國總統柯林頓公開讚揚。本院頒給「建院40年來重大傑出學術成就」獎。

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臺北、臺中、高雄三家榮總和陽明大學開始進行合作研究，稱為「榮陽計畫」，1998年起合併稱為「榮清陽計畫」。

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於教研部下設三個實驗室：分子醫學共同實驗室與臨床共同實驗室、結構生物學實驗室、基因重組實驗室。

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於1998年完成其胺基酸序列，使20多年來國際研究蟲過敏原，始有完整圖譜。

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994年5月，原教學部（下設教學組、醫學圖書組、醫學圖藝組三組），（教學組為原來之「醫學訓練組」、「醫學進修組」合併而成一組），與原醫學研究部（下設廿二個實驗室）合併成為教學研究部，並整修第三層部分圖書館空間，成為教學研究部的行政中樞。合併後之教學研究部主任由內科部新陳代謝科主任何橈通醫師調升。
.....(詳細介紹)

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免疫風濕科主治醫師林孝義發現一例病童患有高尿酸血症、腎結石及嚴重自殘現象，經檢查為性聯遺傳的HGPRT酵素完全缺乏症，並經基因分析證實為點狀突變，是華人社會所發現的第一例 Lesch-Nyhan症候群。

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