「胰臟癌」手術傷口極大、風險極高、切不乾淨，病人生命期短，因此有「癌王」的惡名。胰臟手術是一種極度困難的「大手術」，其中以胰十二指腸切除手術(Whipple手術)最具挑戰性。
本院整合多專科團隊成立「胰臟癌治療暨研究中心」，由石宜銘和王心儀教授率領胰臟外科團隊，克服難關發展高度複雜且困難的「達文西機器手臂胰十二指腸切除微創手術」。相較傳統手術，淋巴腺清除數量更多，出血量更少，大幅減輕病人痛苦。本院目前已完成超過666例，累積豐富經驗，達到世界頂尖水準。
此外，本院率先引進了重粒子治癌技術，針對胰臟癌局部晚期無法手術的患者，化療合併重粒子治療使腫瘤縮小，從而實現腫瘤完全切除乾淨，成為醫學上的奇蹟。是目前世界上完成此種不可能的任務最多的醫院，整體治療滿意度更高達100%。而「化學治療」合併「重粒子治療」使得「手術能完全切除乾淨」的多型性治療，已成為胰臟「癌王」剋星，改寫胰臟癌治療新歷史。讓人們不再聞「癌王」色變。本次一般外科參賽SNQ並榮獲銀牌之殊榮。
臺北榮民總醫院肝癌團隊多年來建立了世界上最大的單一中心肝癌CT影像標註資料庫，並與國立陽明交通大學肝癌AI團隊合作，創新開發多個肝癌AI模型，包括肝癌影像偵測模型、腫瘤型態分類模型、手術及消融治療復發預測模型；通過演化學習的智慧演算功能，成功產生了高準確度的預測结果，並與院内影像系統傳接，使AI模型能於臨床場域落地實用，達成個人化復發風險評估並輔助治療決策，研究成果引領國際。
本院與國立陽明交通大學肝癌AI團隊共同研發的「肝癌診療決策支援系統」在2021年榮獲「國家新創獎:學研新創獎」，2024年以「神機妙算-智慧肝癌風險預測 引領國際」為題榮獲SNQ「國家生技醫療品質獎 銀獎」殊榮。
全世界每年約有89萬人罹患頭頸癌，佔全癌症的5.3%，另每年約有3千多位國人死於頭頸癌，其亦為臺灣癌症發生率的第五名；頭頸癌病人經過一線治療後，仍約有35-40%的產生復發，頸動脈爆裂症候群是一個重新再治療的嚴重的副作用，傳統的治療方式為結紮手術，但合併有較高的死亡率及併發症，現今治療病人大多接受血管內介入治療。
本院神經介入治療團隊1985年由鄧木火教授引入血管內介入治療，就積極發展腦血管疾病的血管內治療，使得本院成為國際上治療頸動脈爆裂症候群的領先者，這些創新的技術包括應用多重介入技術(含栓塞術及覆膜支架置放術)來治療病人，也包括輔助性的使用抗生素及對潛在血管分支的栓塞術，一同提升治療成果。
1990年中以後，張豐基及羅兆寶教授開始針對臺灣高盛行的頭頸癌及其併發的頸動脈爆裂症候群積極介入治療，也不斷改進及創新治療方法，使得本院成為國際上治療頸動脈爆裂症候群的領先者，並獲得2024年SNQ「醫療院所類─醫院特色醫療組銅獎」殊榮。
本院毒藥物防治諮詢中心自1985年起由專業醫療團隊提供全國民眾及醫界全天候二十四小時中毒之緊急諮詢，協助診斷 (含鑑別診斷)、治療及轉診服務。經過30多年的努力，毒藥物防治諮詢中心除了提供全年無休服務並成功協助搶救國內眾多中毒病人，成為亞洲首屈一指的臨床毒物諮詢中心。
2023年，職業醫學及臨床毒物部之毒藥物防治諮詢中心以「毒一無二-毒藥物防治諮詢中心」主題參加國家品質標章SNQ醫療院所類/醫院社區服務組，榮獲銀獎殊榮（金獎從缺）。
自發性顱內低壓是一種由脊椎處腦脊髓液滲漏所造成的急性頭痛疾患，主要的症狀為坐或站立時發生劇烈頭痛，躺下後則緩解，病患發病後通常必須長期臥床，更約有五分之一的病患發生腦部硬膜下腔出血等併發症，對生命造成危害。
王署君副院長表示，傳統的治療方式需要大量輸液和長期臥床，這樣的保守療法只有約28%的成功率，且曠日廢時；本院頭痛團隊在自發性顱內低壓領域深耕二十五年，在診斷和治療方面取得了重大突破，對於腦脊髓液滲漏的治療，以較低侵入性的血液貼片達到有效治療，大幅降低需進行手術修補的比例，並將腦部硬膜下腔出血併發症的發生率減少28.8%。
針對因發生腦部硬膜下腔出血，團隊透過跨專科的合作，及早針對腦脊髓液滲漏以血液貼片修補，並同時由神經外科接力進行腦部硬膜下腔血腫引流。患者自住院到開刀的時間減少56.4%，且因併發症引起之嚴重傷殘或死亡比例降至0%。
本院頭痛團隊於自發性顱內低壓領域發表了25篇重要論文於頂尖國際期刊。研究成果也得到了國際同儕的肯定、被多國採納為臨床指南，更於2023年獲得國家生技醫療品質獎銀獎殊榮。
政府已宣示2050年淨零排放目標，積極鼓勵各界投入永續行動、參與永續工作，行政院國家永續發展委員會為表揚推動永續發展績效卓越單位，以鼓勵全民參與永續發展推動工作，落實永續發展在地化及生活化目標，實現國家永續發展願景。
國家永續發展獎表揚對象類別分：教育類、企業類、民間團體類(分醫院、其他團體)及政府機關類。
本院配合永續行動成立跨科部永續推動小組, 執行各項永續業務，並為2022年「民間團體類」唯一獲獎醫院。
本院榮獲2022年法務部廉政署「透明晶質獎」特優機關，從18個參獎機關脫穎而出，為首次參賽即獲獎的公立醫院，10月27日接受法務部蔡清祥部長頒獎表揚。
「透明晶質獎」評核項目包含「首長決心與持續作為」、「資訊與行政透明」、「風險防制與課責」、「廉政成效的展現」、「廉能創新與擴散」等五大構面。本院將「池化檢驗」模式運用於大規模篩檢，大幅降低檢驗成本，節省鉅額公帑；研發「疫苗殘劑預約系統」，登記預約資訊透明公開；建置「廉政倫理事件線上登錄系統」，有效運用行政資源等，獲得評審委員一致肯定，初次參賽即獲評特優機關。
資訊透明、廉政創新，是臺北榮民總醫院一向堅持的目標。未來，本院將持續運用醫療專業，結合最新科技，提供最高品質的醫療服務，完成每項國家交付的任務，守護國人健康。
刀光血隱-加馬刀放射手術治療腦部血管畸形 臺北榮總加馬刀團隊是由神經外科、神經放射科與放射腫瘤科醫師共同合作,是一個完整、專業且經驗豐富的醫療團隊。從術前的病例討論、術中的治療計畫、到術後的追蹤檢查,可讓病患感受到優質且完善的醫療照護。本團隊目前是臺灣加馬刀手術的第一選擇,並於2021年参與SNQ國家品質標章暨國家生技醫療品質獎榮獲銅獎,得獎證書與品質標章已陳展於加馬刀治療室門口供病患、病患家屬及民眾參觀。
加馬刀是高精密度、且先進的放射手術機種,特別適合深部、高血管性的腦部病灶,具微創、且類似開刀的效果。病患可以免於開顱手術的高風險、以及術後的加護照護。治療的範圍包括中小型的腦部良性腫瘤、腦血管動靜脈畸形與瘻管、轉移性腦瘤、聽神經瘤、三叉神經痛等。自1993年以來,臺北榮總加馬刀團隊已服務超過九千位病患,許多治療方式更為世界首創。在成立近30年的期間,一直以全世界頂尖的醫療水準,持續給國民最完整的臨床照護。
本院骨科部脊椎外科以「解彎取直、重塑美麗人生-引領全國脊椎側彎治療照顧團隊」參加財團法人生技醫療科技政策研究中心舉辦之『SNQ國家品質標章』獲得國家生技醫療品質獎-銅獎。
身障重建中心以「輔具有愛 人生無礙」主題，參與2021年社團法人國家生技醫療產業策進會舉辦之國家品質標章國家生技醫療品質獎（SNQ）醫療院所類/醫院社區服務組，榮獲「2021年SNQ國家生技醫療品質獎-銅獎」肯定。
本院護理部居家護理所以「以病人為中心之多團隊式居家護理照護」主題，參加國家生技醫療品質獎，榮獲「2021年SNQ國家生技醫療品質獎-銅獎」。
本院骨科部以「肢體骨癌之功能重建-領先全球之一條龍治療團隊」主題，參加社團法人國家生技醫療產業策進會舉辦之2017年國家品質標章-國家生技醫療品質獎評選，榮獲銀獎。
本院耳鼻喉頭頸部團隊以「搶救咽喉大作戰-世界一流的頭頸癌照護團隊」主題，參加第21屆「SNQ國家生技醫療品質獎」醫療院所類暨醫院特色醫療組評選，榮獲銀獎及SNQ國家品質標章。
本院唐德成主任領導腎性貧血研發團隊，以「紅潤再現，『腎』利人生，腎性貧血臨床指引–北榮首創、超越歐美、引領全球」主題，參加第21屆「SNQ國家生技醫療品質獎」醫療院所類暨醫院特色醫療組評選，榮獲金獎及SNQ國家品質標章。
AAHRPP是國際上對臨床研究最嚴格之評鑑，包括醫院管理臨床研究的整體架構，研究倫理委員會運作，研究人員相關知能與執行力等面向，獲國際高規格的肯定。
本院一般外科以「胰臟移植-媲美歐美，傲視亞洲，領先台灣」主題，參加社團法人國家生技醫療產業策進會舉辦之2017年國家品質標章-國家生技醫療品質獎評選，榮獲銅獎。
本院護理部及胸腔部以「醫護護航、生命圓滿-胸腔重症加護共享醫療決策之整體性照護」主題，參加社團法人國家生技醫療產業策進會舉辦之2017年國家品質標章-國家生技醫療品質獎評選，榮獲銀獎。
本院耳鼻喉頭頸醫學部以「不再耳漏！臺北榮民總醫院膽脂瘤手術新境界-從實驗室研究到臨床應用」主題，參加社團法人國家生技醫療產業策進會舉辦之2017年國家品質標章-國家生技醫療品質獎評選，榮獲銅獎。
本院護理部以開心圈參加財團法人先鋒品質管制學術研究基金會國際品管圈會議(ICQCC)之全國金銀獎選拔，榮獲金獎品管圈之殊榮，為全國品管圈之最高榮譽。
胸腔重症加護室沸肺圈於代表本院參加第38屆全國金銀獎品管圈競賽榮獲金獎，取得國際品管圈大會參賽權，經由財團法人先鋒品質管制學術研究基金會推薦代表臺灣至泰國曼谷(Thailand Bangkok)參加國際品管圈競賽( International Convention on Quality Control Circle; ICQCC)，榮獲金獎。
本院癲癇手術團隊以「超越『癲』峰！臺北榮民總醫院癲癇手術多領域治療團隊」主題，參加2015年國家生技醫療品質-醫療院所類醫院特色醫療組評選，榮獲國家生技醫療品質獎銅獎及國家品質標章認證。
本院頭痛醫學團隊以「頭痛：贏『頭痛』擊；頭痛醫學領航者-臺北榮總頭痛醫學團隊」主題，參加2014年國家生技醫療品質獎醫院特色醫療組評選，榮獲國家生技醫療品質獎銅獎及國家品質標章認證。
本院骨肉瘤癌團隊以「生物性重建技術、關懷性醫療服務-引領全球骨肉瘤全人照護」主題，參加2014年國家生技醫療品質獎醫院特色醫療組評選，榮獲國家生技醫療品質獎銀獎及國家品質標章認證。
由本院陳適安醫師帶領的心律不整團隊以「心房顫動電燒術-引領全球，開創『心』世紀」主題，奪得2013年國家生技醫療產業策進會醫療院所類醫院特色醫療組金獎及國家生技醫療品質金獎證書。
本院護理部以「安寧居家創意舒適護理」主題，參加2013年國家生技醫療產業策進會國家生技醫療品質-護理照護服務類居家護理服務組類別，榮獲銅獎及SNQ國家品質標章證書。
由經濟部國貿局委託外貿協會舉辦選拔活動，本院榮獲台灣百年百大品牌此一殊榮。
本院以「全面健康管理—開創銀髮新世紀工作圈」榮獲金斧獎，首創開設高齡醫學整合性門診、設立高齡醫學病房，建立跨領域老年醫學團隊；成立高齡醫學中心、推動老年醫學次專科醫師訓練計畫、推行基本資料庫定期周全性老人評估、推動中期照護試辦計畫等，達到促進高齡民眾的健康、提升生活品質並減少醫療支出之目標。