本院癌病中心(腫瘤醫學部)與國立清華大學原子科學技術發展中心合作，成功完成東南亞及全國首例硼捕獲中心於復發頭頸癌之治療，使國內原子爐成為全國第八處，我國成為全國第七個可執行此治療研究的國家。完成東南亞首例硼捕獲中心於復發頭頸癌之治療。
2010年3月22日國立清華大學與本院癌病中心暨日本京都大學(原子爐研究所粒子輻射腫瘤治療中心)，在清大簽訂三方合作協議書，結合本院在癌症治療的專業能力、及日本京大在硼中子捕獲治療(Boron Neytron Capture Therapy , BNCT)的臨床實務經驗，共同努力以清華水池式反應器（Tsing Hua Open-pool Reactor, THOR）超熱中子束進行的臨床研究合作，為癌病病患提供新的治療方法。