1959年本院創立時，耳鼻喉部原為隸屬於外科部的一個科。1975年脫離外科部，成為獨立科。此時，陽明醫學院（1994年改制為陽明大學）在與本院相鄰的後山成立，而本院同時也成為陽明的教學醫院。1984年耳鼻喉科升格為部，並設以下三科：耳科Otology、鼻（頭頸）科 Rhinology-Head & Neck Surgery、喉（頭頸）科 Laryngology-Head & Neck Surgery。為了讓各科主治醫師和主任更有效率的累積專科經驗，並在深厚的臨床基礎上進行研發，提供更專精的醫療服務；本院耳鼻喉部實施分科掛號看診，以及各科醫療、教學、研究和績效獨立運作的特殊團隊合作模式，也培養出無數優秀的耳鼻喉專科醫師。
此外，各科也陸續引進國際一流技術，從事新進的醫療研發，並主辦各種研習會和醫學會，為提昇耳鼻喉專科水準而努力。2013年11月本部正式更名為耳鼻喉頭頸部。因醫療技術日新月異，耳鼻喉科領域亦朝向多元化精進，本部於2017年10月1日正式更名為耳鼻喉頭頸醫學部，以利本部長遠之發展。本部致力於提供病患最高水準的醫療，耳科團隊以「聽見幸福！中耳炎併膽脂瘤治療新境界-從實驗室研究，創新手術到聽能復健」為題，榮獲2017年度SNQ國家生技醫療品質獎-銅獎。喉頭頸科更於2018年度以「搶救咽喉大作戰-世界一流的頭頸癌照護團隊」榮獲國家生技醫療品質獎-銀獎的殊榮。
節錄自本院官網