國際醫療中心成立於2008年5月，原屬醫務企管部下任務編組二級單位，2022年11月升格一級單位，下轄國際醫療服務科、國際醫療規劃科、醫學合作推展科。
掌理事項有國際醫療、人道醫療援助、國際醫療交流事務，並配合執行政府國際醫療政策。除負責國際醫療病人就醫、營造文化友善醫療環境外，也肩負許多參訪、宣傳以及合作備忘錄洽談簽署等工作，亦積極參與推動政府國際醫療相關計畫。
自2018年起統籌「榮陽團隊」-包括臺北榮總、臺中榮總、高雄榮總及國立陽明交通大學，執行政府新南向一國一中心於越南的國際醫療計畫，辦理雙邊醫衛合作交流、醫事人員培訓、促進醫衛資通產業交流等。
另參與執行國合會友好國家醫事人員訓練計畫、聖克里斯多福及尼維斯慢性腎臟病基礎防治體系建構計畫(2017-2020)、聖克里斯多福及尼維斯代謝性慢性病防治體系強化計畫(2020-2024)、聖克里斯多福及尼維斯心理健康韌性強化計畫(2024-2027)、太平洋友邦醫療合作計畫-諾魯醫療常駐計畫(2013-2021)等。
歷任主任為李偉強醫師、王必勝醫師、顏鴻章醫師、林志慶醫師，升級正式一級單位首任中心主任為劉君恕醫師。