本院2025年5月22日宣布與兩家印尼醫療機構簽署了重要的合作備忘錄，進一步強化雙邊的醫療合作與交流。一是位於首都雅加達的頂尖公立醫院 RSCM Dr. Cipto Mangunkusumo醫院續簽長期合作(RSCM被BrandFinance評為2023年全球「最具聲望學術醫療中心」第36名，是印尼領先的公立醫院，並以其卓越的醫療服務享譽盛名)；二是與快速擴張的私立醫院體系 DKH醫院集團建立新的合作(DKH醫院集團在西爪哇經營五家醫院，致力於為該國人口最稠密地區的低收入群體提供全民醫療服務。其使命在於為弱勢社區提供教育和醫療保健。)
本院與RSCM Dr. Cipto Mangunkusumo醫院續簽的合作備忘錄，是建立在2017年啟動的成功合作基礎之上，此前的合作顯著促進了醫師交流計畫，特別是在骨科領域。此次續簽旨在將合作擴展到更多的臨床領域。
當日，本院代表團亦受到DKH醫院集團的熱情接待。DKH創辦人Iqbal Rahim Wilis先生和執行長Satria Wilis先生2024年曾訪問本院，亦表達了對臺灣醫療創新的欽佩，雙方就醫院管理系統、癌症治療、人員發展、教育培訓等多個領域進行了廣泛討論，啟發了DKH對於「他們理想醫院」的願景和實踐。
本院副院長暨代表團團長李偉強教授表示：「這次印尼之行成果豐碩，我們的印尼夥伴高度讚賞臺灣醫院所追求的整體性照護、專注護理以及人工智慧和高科技的應用。與RSCM續簽合作備忘錄以及與DKH醫院集團建立新夥伴關係，都顯著加深了我們對印尼醫療領域的承諾。」
而本院國際醫療中心主任劉君恕教授也強調：「繼我們在越南成功且具影響力的計畫之後，印尼已成為臺北榮總在東南亞的關鍵重點市場。我們看到印尼夥伴對於尋求臺灣先進醫療專業知識的興趣日益增長，並渴望複製和培養我們在越南所取得的積極成果，我們相信這些合作不僅將造福兩地的醫療體系，也將促進更緊密的人文連結。」
此次任務凸顯本院在促進國際醫療交流方面的積極作為，及在臺灣「新南向政策」框架下，推動醫療進步的奉獻精神。本院已成功與越南建立合作，簽署了30份合作備忘錄，並積極在當地醫院開展各類合作計畫。迄今為止，本院還透過合作備忘錄與印尼的三家醫院建立了夥伴關係，同時在特定專科領域（如心血管疾病）與其他醫院保持密切友誼。