臺北榮總中正樓落成於1989年10月，嬰兒室設於8樓83區，有個長長的嬰兒探視走廊。新生兒普通病房設於9樓，重症新生兒則收治於兒童加護病房。
因醫療進步及全民健保實施，早產兒及重症新生兒醫療需求增加，本院分別於1994年3月及1995年5月於原嬰兒室後方設置新生兒中重度病房及新生兒加護病房。
隨著時間進展及醫療型態的進步，本院爲使住院新生兒、家屬及醫療人員有更好的醫療環境，大刀闊斧重整空間，拆除原設施，融入以人爲中心的概念，全面整建，於2021年5月4日完工後正式開幕。
完工後的新生 兒醫療中心包含嬰兒室(Baby room,BR)、新生兒中重度病房(Intermediate Care Nursery,ICN)及新生兒加護病房(Neonatal Intensive Care Unit, NICU)，全方位照護新生兒。