2003年3月國內首度爆發SARS疫情,本院不但成立工作小組及協調中心,並將長青樓騰空改建為SARS專責負壓隔離病房56床,連同中正樓感染科、胸腔科收治SARS病床,共116張,全力救治病人。SARS期間收治病患280位,設立發燒篩檢中心,制定工作守則,嚴密監督,對SARS疫情控制貢獻卓著。